• 2022年第0卷第4期文章目次
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    • >医学图像与成像
    • 基于多模态影像的难治性颞叶癫痫分型研究

      2022(4):188-198. CSTR:

      摘要 (1374) HTML (0) PDF 1.87 M (2994) 评论 (0) 收藏

      摘要:约1/4的难治性颞叶癫痫患者的发作无法通过常规前颞叶切除术得到有效控制,这可能是因为疾病存在多种复杂的亚型,且部分亚型涉及颞叶外的脑区病变。基于多模态脑影像特征,使用隐含狄利克雷分布模型可以估计潜在疾病因子及各因子在患者大脑内表达程度,有助于个体精准分型。本研究通过PET/MR同步一体扫描仪采集了86例难治性颞叶癫痫患者的T1加权影像和FDG PET影像,并采集39位健康志愿者的T1加权影像和36位健康志愿者的FDG PET 影像作为对照。研究提取与癫痫病理相关的灰质体积和葡萄糖摄取值,使用隐含狄利克雷分布进行分型,将疾病因子的数量分别设为3、4、5进行多次实验,并对四因子模型中的各疾病因子与临床指标之间的关系进行统计分析。研究发现,选取不同数量的疾病因子进行分型时得到的结果具有一定的相似性。在四因子模型中存在与病灶偏侧性、发作年限和认知能力显著相关(P<0.05)的疾病因子。本研究对颞叶癫痫分型具有一定参考价值。

    • 用于DBS手术机器人系统的MRI射频线圈优化设计

      2022(4):199-206. CSTR:

      摘要 (1196) HTML (0) PDF 1.83 M (2884) 评论 (0) 收藏

      摘要:基于一个传统脑深度刺激(deep brain stimulation,DBS)手术机器人配合实时磁共振成像导航的系统,设计了一款有高开放性的八通道相控阵列头部线圈。对磁共振接收线圈链路功能进行分析,配合线圈开放性需求,运用Proteus软件设计功能电路并集成于3.76 cm×3.54 cm空间内,并将电路应用于平面线圈阵列并对人体腹部成像验证可行性。确立硬件电路部分可行性后,针对手术机器人系统进针空间需求,对当前头部射频接收线圈结构进行高开放性的优化并运用HFSS仿真软件设计建模。仿真结果显示反射系数均达-40 dB,相邻线圈基本都优于-10 dB。为DBS手术机器人实时MRI影像导航提供高信噪比与开放性的射频接收线圈奠定技术基础。

    • 一种基于胶囊网络外膜蛋白拓扑结构预测方法

      2022(4):207-218. CSTR:

      摘要 (991) HTML (0) PDF 1.32 M (2703) 评论 (0) 收藏

      摘要:目的 采用计算手段探索在当前外膜蛋白小样本的条件下提升外膜蛋白拓扑结构预测精度的深度学习方法。方法 首先选取和构建适用于预测外膜蛋白拓扑结构的数据集;第二,经特征筛选和对比实验确定模型的最优输入;第三,构建和优化基于胶囊网络的拓扑结构预测模型TopOMP-capsnet;最后通过对比同类方法评估和验证模型性能。结果和结论 拓扑结构预测模型TopOMP-capsnet与同类方法对比性能有所提升,证明深度学习技术能够在有限样本条件下识别相应序列模式,有助于外膜蛋白结构和功能的大规模分类及筛选。创新之处 拓扑结构预测模型TopOMP-capsnet的三态预测准确率(Q3)达到87.7%,优于传统机器学习方法。

    • 精神分裂症组蛋白修饰与神经递质系统关系的多组学研究

      2022(4):219-222. CSTR:

      摘要 (1079) HTML (0) PDF 1.15 M (2783) 评论 (0) 收藏

      摘要:①目的:探索组蛋白修饰通过神经递质系统影响精神分裂症发病风险的途径;②方法:利用WGCNA工具对精神分裂症患者脑表达谱建立了的组蛋白-神经递质间的基因共表达网络,分析患者和健康对照是否在组蛋白-神经递质的关联关系上存在差异。③患者大脑中组蛋白-神经递质系统相关性显著降低;通过辨别网络中疾病差异表达和新发突变的核心组蛋白修饰基因的分布,我们发现了CALM2、PRKAR1A、CAPZA2、BSN、GRIN1、LRFN3六个候选基因可能是精神分裂症遗传风险的关键基因。

    • MEK1及其突变体的曲美替尼结合轨迹马尔可夫模型分析

      2022(4):223-229. CSTR:

      摘要 (725) HTML (0) PDF 1.95 M (1448) 评论 (0) 收藏

      摘要:MEK1是Ras-Raf-MEK-ERK通路中重要的信号分子。在肿瘤发生中发挥着重要的作用。通路的Raf、MEK1等基因发生突变,导致通路被持续活化被认为是导致肿瘤无限增殖的重要原因之一。曲美替尼能有效的抑制MEK1的活性,MEK1结构中α螺旋的消失会降低曲美替尼的治疗效果。本实验通过PCCA+聚类分析、马尔可夫模型和通量分析等方法,对E203K突变体和曲美替尼的作用轨迹进行分析,研究发现E203K、P124S和野生型在与曲美替尼作用时,C166-S181部分靠近曲美替尼的一端都会发生解旋变为氢键转角,而远端结构变化有差异。

    • >分子生物学
    • 转录组测序分析NSD2在骨髓B细胞发育中的作用机制

      2022(4):230-237. CSTR:

      摘要 (301) HTML (0) PDF 2.04 M (1598) 评论 (0) 收藏

      摘要:免疫缺陷主要由免疫细胞发育,分化和功能异常导致。已有研究表明,表观遗传调控对于免疫细胞的正常发育具有重要作用。该研究发现组蛋白甲基转移酶NSD2对于B细胞的发育起着重要的调控作用,并且利用转录组测序找到了调节B细胞发育的重要通路。此研究为免疫缺陷病的治疗提供了新的治疗靶点。

    • >其他
    • 盆腔肿瘤放化疗与骨髓抑制相关性的研究进展

      2022(4):238-245. CSTR:

      摘要 (804) HTML (0) PDF 458.30 K (2235) 评论 (0) 收藏

      摘要:骨髓抑制风险识别是肿瘤放化疗治疗中需要解决的一个重要问题,本文从放疗技术、放疗剂量学参数和化疗方案等方面对国内外肿瘤放化疗与骨髓抑制相关性的研究现状进行综述,为构建我国骨髓抑制预测模型提供参考,以便早期识别高危人群,进行针对性预防和治疗。

    • 关于生物医学工程研究生培养改革的思考与探索

      2022(4):246-250. CSTR:

      摘要 (925) HTML (0) PDF 314.22 K (2743) 评论 (0) 收藏

      摘要:生物医学工程作为新兴交叉学科,在国家战略背景下,对人才培养提出了更高要求,现有的培养模式难以实现培养目标,需要不断改革创新。本文分析了目前高校生物医学工程专业研究生培养存在的普遍问题,并以上海交通大学生物医学工程专业为例,从课程体系调整、医学类课程和实践育人环节的增加等方面实施了一系列的改革措施并提出进一步发展的思考,以期大幅度提升教学质量,完善我国生物医学工程专业的研究生人才培养体系,提升研究生医工融合能力、产学研践行能力,造福人民健康。

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